Компания создана в 1993 году новосибирцем Игорем Рудинским. В 1999-м его партнером стал предприниматель Шабтай Калманович (убит в 2009 году). В 2006-м СИА стала лидером оптового рынка лекарств, опередив компанию «Протек», но затем вернулась на второе место. В 2007 году долю в СИА собиралась купить Millhouse Романа Абрамовича, но сделка не состоялась. В 2008 году 50% акций СИА купил фонд TPG, а в 2010-м она сама купила 25% акций сети аптек «36,6». Владеет тремя фармацевтическими заводами и контролирует четверть лекарственного рынка России.